2005年5月28日，市委常委扩大会议对加快滨州港建设进行了专门研究和部署，提出航道疏浚、商港、渔港、造船、油盐化工“五位一体”的总体工作思路。从此，滨州港跳出内海，走向深蓝，拉开了万吨级大港建设序幕。

2006年，《滨州港总体规划》作为地方一般港口由滨州市政府批准实施。

2007年，滨州市政府确定了“以港兴市”的战略，强力推进滨州万吨级港口建设。

2010年，滨州市紧抓“黄蓝”两区开发的历史机遇，把滨州港确定为2011年全市的“一号工程”重点推进。

2010年3月，滨州港疏港公路开建。

2010年4月，滨州港防波堤、防潮堤一期工程开建，正式启动滨州港大规模开发建设。

2010年4月，滨州港2×3万吨级码头及附属工程正式开工建设。

2010年9月30日，疏港公路竣工通车。

2010年12月17日，山东省人民政府下发了《关于将潍坊港等3个港口确定为地区性重要港口的批复》，将滨州港提升为地区性重要港口。

2012年3月5日，修改后的《滨州港总体规划》（2011-2030年）获省政府和交通运输部正式批复。

2013年5月16日，由中交烟台环保疏浚公司承建的滨州港防波堤一期工程顺利通过省质监总站验收。

2013年8月15日，防波堤二期工程开建。

2013年10月10日，市政府组织召开全市口岸开放工作专题会议，对滨州港申报一类口岸工作进行安排部署，滨州港正式准备申报国家一类开发口岸。

2014年8月14日，滨州市政府与青岛港（集团）有限公司《战略合作框架协议》签约仪式在滨州举行。

2015年6月26日，滨州港2个3万吨级散杂货码头开航运营,这在滨州港发展史上具有里程碑式的意义。

2017年4月，滨州港2个3万吨级液体化工泊位投入运营,滨州港投入运营的泊位达到4个。

2017年12月22日，滨州港一类开放口岸获国务院批复，结束了滨州作为全省7个沿海市唯一没有实现口岸开放的现实，标志着滨州真正打开了融入世界的“海上大门”。

2018年2月13日，中共滨州港务集团有限责任公司委员会正式成立。

2018年8月30日，滨州港6#7#液化品泊位工程主体完工。

2019年4月26日，滨州港务集团整体移交山东渤海湾港口集团托管。

2019年8月6日，山东省港口集团有限公司在青岛正式挂牌成立，全省7个地市的港口握指成拳，开启了全省港口一体化改革发展的大幕。

2019年10月16日，滨州港首次同时靠泊两艘3万吨级原油货轮。

2019年10月30日，“滨州—威海—青岛”、“滨州—烟台”两条省内集装箱航线正式开通。

2020年2月9日，山东滨州港海港船舶代理有限公司迎来的第一单船代业务。

2020年2月11日，“滨州-盘锦”集装箱内贸航线正式开通运营。

2020年3月16日，滨州港迎来历史上第一单货代业务，也是滨州港首次接卸石油焦货种，创造了滨州港的“双首次”。

2020年3月25日，山东港口集团领导、渤海湾港口集团党委书记、董事长孙正甫拜会滨州市委书记、市人大常委会主任佘春明，并与滨州市就港口建设发展、物流园区建设、港产城融合发展等事宜深入座谈，达成重要共识。

2020年7月16日，山东省港口集团与滨州市人民政府战略合作协议签订仪式在山东港口滨州港举行。

2020年10月22日，经国家验收组查验、评审，山东港口滨州港口岸对外开放通过国家验收。

2020年11月9日，山东滨州港口岸对国际航行船舶开放。

2020年，全年泊位利用率63%，完成吞吐量681万吨（同比增长18%），实现国家一类口岸对外开放验收。

2021年2月11日，“滨州—盘锦”集装箱内贸航线正式开通运营。

2021年5月4日，来自乌拉圭蒙得维的亚港专业活畜运输船“安娜”轮搭载13100头种牛，成功靠泊山东港口滨州港散杂货码头，创造国内单批次进口活牛数量最大纪录。

2021年11月1日，来自俄罗斯纳霍德卡港的“赛西尔”轮装载29170吨海关济南关区首船保供煤炭成功靠泊山东港口滨州港散杂货码头，有效缓解滨州腹地能源供应紧张局面。

2021年12月21日，山东港口滨州港3万吨级散杂货码头泊位减载靠泊能力获山东省交通运输厅批复，滨州港两个3万吨级散杂货泊位在限定条件下靠泊等级由3万吨级提升至7万吨级。作为渤海湾港首个具备7万吨级船舶靠泊能力的泊位，对推动港口大跨步发展具有里程碑式的意义。

2021年，全年泊位利用率提升至70%，完成吞吐量841万吨（同比增长23%），集装箱15222TEU；实现营业收入14694万元。